Eristetyn Yaravirus-virionin negatiivinen värjäys. (Boratto et ai., 2020, bioRxiv) Tiedemiehet ovat tunnistaneet arvoituksellisenvirusjoiden genomi näyttää olevan tieteelle lähes täysin uusi, ja sen kantaa tuntemattomat geenit, joita ei ole koskaan aiemmin dokumentoitu virustutkimuksessa.
Niin kutsuttu Yaravirus, joka on nimetty sen mukaan Lapset – tai Iara, vesikuningatarhahmo brasilialaisessa mytologiassa – löydettiin Pampulha-järvestä, tekojärvestä Brasilian Belo Horizonten kaupungista.
Vaikka Yaravirus ( Yaravirus brasiliensis ) ei välttämättä ole yliluonnollinen sireeni virus voi osoittautua yhtä salaperäiseksi kuin legendan vesinymfi.
Tämä johtuu siitä, että virus muodostaa 'uuden amebaaliviruksen sukulinjan, jolla on hämmentävä alkuperä ja fysiologia', tutkimusryhmä. selittää uudessa esipainetussa paperissa löydöstä.
Kahden ryhmän vanhemmista jäsenistä – virologien Bernard La Scolan Aix-Marseillen yliopistosta Ranskasta ja Jônatas S. Abrahãon Brasilian Minas Geraisin liittovaltion yliopistosta – pitäisi tietää, mistä he puhuvat.
Kaksi vuotta sitten pariskunta auttoi löytämään toisen vedessä elävän virusuutuuden:Tupanvirus, jättimäinen virus, jota löytyy äärimmäisistä vesiympäristöistä.
Jättiläisiä viruksia, toisin kuin tavallinen lajike, ovat niin sanottuja valtavien kapsidiensa vuoksi (proteiinikuoret, jotka kapseloivat virioneja - viruspartikkeleita).
Nämä paljon suuremmat virusmuodot olivat vainlöydetty tällä vuosisadalla, mutta ne eivät ole vain merkittäviä kokonsa vuoksi. Heillä on myös monimutkaisempia genomeja, mikä antaa heillekyky syntetisoida proteiineja, ja siksi suorittavat asioita, kuten DNA:n korjauksen sekä DNA:n replikoinnin, transkription ja translaation.
Ennen niiden löytämistä luultiin, että viruksia ei voinut tehdä sellaisia asioita, koska häntä pidettiin suhteellisen inerttinä,ei-eläviä olentoja, jotka voivat tartuttaa vain isäntiään.
Tiedämme nyt, että virukset ovatpaljon monimutkaisempi kuin koskaan uskottiin, ja viime vuosina tutkijat ovat paljastaneetmuunlaisia virusmuotojajotka haastavat samalla tavalla ajattelummemiten virukset voivat levitäjatoiminto.
Uusi löytö, Yaravirus, ei vaikuta jättiläisvirukselta, koska se koostuu pienistä 80 nm:n kokoisista hiukkasista. Mutta huomionarvoista siinä on, kuinka ainutlaatuinen sen genomi on.
'Useimmilla tunnetuilla ameebaviruksilla on havaittu olevan monia yhteisiä piirteitä, jotka lopulta saivat kirjoittajat luokittelemaan ne yhteisiin evoluutioryhmiin.' kirjoittajat kirjoittavat .
'Toisin kuin muissa eristetyissä ameebaviruksissa havaitaan, Yaravirusta ei edusta suuri/jättimäinen hiukkanen ja monimutkainen genomi, vaan se kantaa samalla merkittävän määrän aiemmin kuvaamattomia geenejä.'
Tutkimuksissaan tutkijat havaitsivat, että yli 90 prosenttia Yaraviruksen geeneistä ei ollut koskaan aiemmin kuvattu, ja ne muodostavat ns. orpogeenit (alias ORFans).
Vain kuusi löydettyä geeniä muistutti kaukaa tunnettuja virusgeenejä, jotka on dokumentoitu julkisissa tieteellisissä tietokannoissa, ja haku yli 8 500 julkisesti saatavilla olevasta metagenomista ei antanut mitään vihjeitä siitä, mihin Yaravirus voisi olla läheistä sukua.
'Vakioprotokollia käyttämällä ensimmäinen geneettinen analyysimme ei pystynyt löytämään tunnistettavia kapsidi- tai muiden klassisten virusgeenien sekvenssejä Yaraviruksesta.' tutkijat selittävät .
'Nykyisten virusten havaitsemiseen tarkoitettujen metagenomisten protokollien mukaisesti Yaravirusta ei edes tunnistettaisi virusten aiheuttajaksi.'
Mitä tulee Yaravirukseen, tiedemiehet voivat toistaiseksi vain spekuloida, mutta ehdottavat, että kyseessä voi olla ensimmäinen yksittäistapaus tuntemattomasta amebaaliviruksen ryhmästä tai mahdollisesti kaukaisesta jättiläisviruksesta, joka on jollain tapaa kehittynyt pelkistettyyn muotoon. .
Joka tapauksessa on selvää, että meillä on vielä hirveän paljon opittavaa, tutkijat sanovat.
'Yaraviruspartikkeleista muodostuvien tuntemattomien proteiinien määrä heijastaa virusmaailmassa vallitsevaa vaihtelua ja sitä, kuinka paljon uusia virusgenomeja on vielä löydettävä.' kirjoittajat päättelevät .
Löydökset on raportoitu vuonna bioRxiv .